Eine Karte von regulatorischen DNA-Sequenzen

Auf dem Weg, haben Forscher die bekannte Theorie, daß krankheitsverursachenden Mutationen oft nicht die Gene selbst kommen, sondern in der Reihenfolge bestätigt, Regulierung ihrer Aktivität.

Wenn wir über die Gene, die in der Regel bedeuten, eine DNA-Sequenz, die ein Protein zu sprechen. Hier wird die Insulin-Gen, das Gen Kollagen Gens einige Protease (Enzym, das andere Proteine ​​bricht) usw. Aber wir alle - mehrzelligen Wesen, und unser “viele Zellen” zum Teil dramatisch anders: Vergleichen Neuron mit intestinalen Epithelzellen und fühlen Sie den Unterschied. Aber in jeder Zelle der Gene identisch sind. Aber Gene bestimmen weitgehend die Struktur und Funktion der Zelle … In der Regel ist es klar, dass verschiedene Gene in verschiedenen Zellen funktionieren anders. Vergessen Sie auch nicht, dass die Zelle selbst hat sehr intensive Art der Entwicklung, und für das Leben Aktivität ihrer Gene wieder geändert.

So kommen wir auf die Idee, die Existenz von Regulierungsbehörden, Schalter, Schalter und Schalter, die die Aktivität von Genen in das Leben einer Zelle zu ändern, abhängig von der Spezialisierung und der aktuellen Umweltbedingungen. In der Tat existiert eine solche regulatorische Apparat, und es ist wirklich große ist. Und Genregulation stützt sich stark auf bestimmte Sequenzen in der DNA selbst, die keine Informationen über Proteine ​​tragen nicht, aber sie Signale für spezifische Proteine, koi sind, interagiert mit DNA-Regulationselement, stärken oder schwächen ein Gen. Solche DNA-Sequenzen sind beispielsweise Promotoren, ohne die Transkription kann kaum beginnen und Enhancer, die ziemlich weit von der kontrollierten Gens lokalisiert sein kann, aber trotzdem einen starken Einfluss auf ihn auszuüben.

All dies ist eine lange Vorrede müssen wir den Wert der Arbeit von einem internationalen Forschungskonsortium Fantom (Functional Annotation des Genoms von Säugetieren), von japanischen Wissenschaftlern aus dem Institut für RIKEN führte geführt voll fühlen. Die Essenz ihrer Ergebnisse ausgedrückt werden kann in einem kurzen Satz, waren die Forscher in der Lage, eine nahezu vollständige Karte von regulatorischen DNA-Elemente des menschlichen Genoms zu konstruieren.

Hier sind einige relevante Zahlen: Fantom-Projekt begann im Jahr 2000, sie enthalten mehr als 250 Fachkräfte, vor allem in der Zellbiologie und Bioinformatik, was 114 Forschungszentren in mehr als 20 Ländern. Regulatorische Sequenzen werden mit Hilfe der Kappe-Analyse der Genexpression (CAGE) am RIKEN entwickelte gesucht. Ohne in die Details dieser Methode können wir nur sagen, dass es erlaubt nur, dass Sie “fangen” die Sequenzen, die die Transkription regulieren, und funktioniert sogar mit in diesem Sinne nicht zu Gene aktiv. Darüber hinaus ermöglicht CAGE nicht mit einer sehr großen Menge von Source-Zellen behandeln.

Sie arbeiteten mit einer enormen Anzahl von Zellen, Mensch und Maus. Ergebnis: 180 000 beschriebenen Promotor-Sequenzen und 44 000 Verstärker-Sequenzen. All diese Masse von Daten in wissenschaftlichen Fachzeitschriften zurückgegangen, nach einer Studie …

28 March 2014

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